Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn4Q69Z26 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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