Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp4Q68FH0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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