Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spty2d1Q68FG3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms