Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Papd5Q68ED3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms