Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms