Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pan3Q640Q5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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