Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aebp1Q640N1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms