Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc18Q640L5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc18Q640L5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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