Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms