Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vil1Q62468 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms