Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms