Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms