Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm5dQ62240 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm5dQ62240 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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