Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms