Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms