Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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