Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms