Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms