Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrxQ61687 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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