Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms