Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cntn2Q61330 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cntn2Q61330 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cntn2Q61330 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cntn2Q61330 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn2Q61330 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms