Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Abcd2Q61285 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Abcd2Q61285 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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