Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf9Q61179 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms