Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp17laQ61068 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp17laQ61068 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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