Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sim1Q61045 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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