Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf3Q60980 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms