Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms