Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Caprin1Q60865 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms