Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Traf3Q60803 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Traf3Q60803 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Traf3Q60803 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms