Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms