Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm1Q60636 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm1Q60636 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms