Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms