Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssh2Q5SW75 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms