Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf12Q5SPL2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms