Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms