Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp28Q5I043 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp28Q5I043 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp28Q5I043 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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