Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms