Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc47Q505F5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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