Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zfp235Q499D5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms