Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms