Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms