Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt35Q497I4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms