Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms