Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms