Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc9Q3V038 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc9Q3V038 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ttc9Q3V038 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms