Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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D130052B06RikQ3UW13 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D130052B06RikQ3UW13 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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D130052B06RikQ3UW13 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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D130052B06RikQ3UW13 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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D130052B06RikQ3UW13 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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D130052B06RikQ3UW13 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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D130052B06RikQ3UW13 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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