Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Skap1Q3UUV5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms