Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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BB287469Q3UT53 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BB287469Q3UT53 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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BB287469Q3UT53 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BB287469Q3UT53 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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