Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms