Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms